Laboratorium Studi Al-Qur’an dan Hadis (LSQH) Fakultas Ushuluddin dan Pemikiran Islam (FUPI) Universitas Islam Negeri (UIN) Sunan Kalijaga Yogyakarta merupakan salah satu laboratorium yang berada di bawah naungan dua program studi, yaitu program studi S1 dan S2 Ilmu Al-Qur’an dan Tafsir (IAT) serta S1 Ilmu Hadis (Ilha). LSQH mempunyai visi “Unggul dan Terkemuka dalam Studi Akademik Al-Qur’an dan Hadis.” Visi tersebut diwujudkan melalui lima misi, yaitu (1) menyelenggarakan kajian akademik Al-Qur’an dan Hadis, (2) menjadikan nilai-nilai dasar Al-Qur’an dan Hadis sebagai inspirasi dalam kehidupan bermasyarakat, berbangsa dan bernegara, (3) melaksanakan pengabdian masyarakat berwawasan Al-Qur’an dan Hadis, (4) melakukan kegiatan penerjemahan dan penerbitan terkait kajian Al-Qur’an dan Hadis dan (5) membangun kerja sama dengan lembaga-lembaga yang relevan di dalam dan luar negeri.

LSQH mempunyai empat divisi, yaitu divisi kajian dan wacana, divisi penelitian dan publikasi, divisi kerja sama dan divisi pengabdian. Sedangkan program unggulan yang dicanangkan oleh Pengurus LSQH Periode 2022-2024 adalah pusat kajian keilmuan dan penelitian, penguatan kerjasama, kajian living Qur'an dan Hadis, penerjemahan rujukan keilmuan strategis, pengelolaan website dan media sosial serta pengkaderan (manajemen anggota) yang berasal dari sumber daya manusia yang unggul dan potensial. Program LSQH yang sudah berjalan antara lain kajian dan diskusi kitab al-Tafsīr wa Rijāluhu karya Muḥammad al-Fāḍil bin ‘Āsyūr (w. 1970) oleh Dr. Abdul Jalil, S.Th.I., M.S.I. setiap Kamis pukul 12.00 WIB di ruang baca LSQH lantai 3 Fakultas Ushuluddin dan Pemikiran Islam UIN Sunan Kalijaga Yogyakarta. Kegiatan lainnya seperti penerjemahan, perekrutan anggota dan peneliti madya (associate member and researcher), pembuatan website, lokakarya (workshop) metodologi dan lainnya.